80 ans se sont écoulés depuis les événements évoqués dans Macross. Les descendants des Zentradi et des métrandi ont créé une nouvelle société terrienne en harmonie avec les humains. Tous vivent maintenant côte à côte, sur Terre, dans une paix fragile.

OAV 1 : Contact
Une flotte spatiale non-identifiée entre dans le système solaire. Sont-ce des Zentradiens ? Ils manifestent pourtant une étonnante résistance envers "l'opération Minmei" ?

OAV 2 : Ishtar
Hibiki Hakari, journaliste qui enquête sans vergogne sur la vie privée de la meilleure pilote de Valkyrie de l'U.N.Spacy, tombe sur un scoop quand il peut exploiter le premier contact direct avec le mystérieux envahisseur, survenu dans l'épisode précédent.

OAV 3 : Festival
Ishtar, à la recherche du secret du SDF-1, visite l'ancienne forteresse spatiale avec Hibiki. Ils semblent cependant suivis. Détectant la présence de leur émulateur, les Marduks et leurs guerriers Zentradi en profitent également pour attaquer...

OAV 4 : Aux mains des Marduks
Prisonnier des Marduks, Hibiki est sur le point d'être executé. Sylvie Gena tente de lui porter secours. Mais Feff, puissant guerrier Marduk, tente de sauver Ishtar avant que son vaisseau spatial "contaminé" par la culture Terrienne ne soit annihilé sur ordre de l'Empereur fou Ingues...